Szczepionki podjednostkowe typu subunit zawierają białko wirusa, przeciw któremu wytwarzane są przeciwciała. Białko do tej szczepionki powstaje w komórkach motyli, a odpowiedź immunologiczną wzmacnia substancja z mydłodrzewu. Rekombinowanie białek jest tradycyjną i stosowaną metodą wytwarzania szczepionek. Dzięki tej metodzie możliwe było opracowanie m.in. szczepionek przeciw wirusowemu zapaleniu wątroby typu B (WZW B) czy ludzkiemu wirusowi brodawczaka (HPV).
Przykładem tej szczepionki jest niedopuszczony jeszcze do obrotu amerykański dwudawkowy preparat Novavax, który według wstępnych danych daje 90-proc. ochronę przed zakażeniem koronawirusem. Według danych z początku 2021 r., Polska miała zakontraktowany zakup ponad 8 mln dawek.